Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms