Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms