Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms