Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MC1RQ01726 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MC1RQ01726 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MC1RQ01726 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MC1RQ01726 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MC1RQ01726 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MC1RQ01726 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MC1RQ01726 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MC1RQ01726 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MC1RQ01726 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MC1RQ01726 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MC1RQ01726 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MC1RQ01726 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MC1RQ01726 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MC1RQ01726 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MC1RQ01726 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MC1RQ01726 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MC1RQ01726 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MC1RQ01726 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MC1RQ01726 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MC1RQ01726 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MC1RQ01726 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MC1RQ01726 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MC1RQ01726 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MC1RQ01726 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MC1RQ01726 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MC1RQ01726 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MC1RQ01726 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MC1RQ01726 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MC1RQ01726 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MC1RQ01726 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MC1RQ01726 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MC1RQ01726 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MC1RQ01726 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MC1RQ01726 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MC1RQ01726 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MC1RQ01726 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MC1RQ01726 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MC1RQ01726 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MC1RQ01726 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MC1RQ01726 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MC1RQ01726 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MC1RQ01726 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MC1RQ01726 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
MC1RQ01726 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MC1RQ01726 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MC1RQ01726 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MC1RQ01726 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MC1RQ01726 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MC1RQ01726 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MC1RQ01726 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
MC1RQ01726 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MC1RQ01726 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MC1RQ01726 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
MC1RQ01726 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MC1RQ01726 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms