Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms