Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRB1P82279 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRB1P82279 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRB1P82279 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRB1P82279 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRB1P82279 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRB1P82279 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRB1P82279 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRB1P82279 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRB1P82279 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRB1P82279 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRB1P82279 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRB1P82279 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRB1P82279 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CRB1P82279 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRB1P82279 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CRB1P82279 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CRB1P82279 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRB1P82279 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRB1P82279 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRB1P82279 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRB1P82279 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRB1P82279 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CRB1P82279 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRB1P82279 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRB1P82279 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CRB1P82279 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRB1P82279 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRB1P82279 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRB1P82279 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRB1P82279 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRB1P82279 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CRB1P82279 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRB1P82279 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRB1P82279 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRB1P82279 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRB1P82279 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRB1P82279 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRB1P82279 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRB1P82279 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRB1P82279 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRB1P82279 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRB1P82279 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRB1P82279 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRB1P82279 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRB1P82279 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRB1P82279 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRB1P82279 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRB1P82279 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRB1P82279 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRB1P82279 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRB1P82279 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRB1P82279 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRB1P82279 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRB1P82279 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRB1P82279 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRB1P82279 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRB1P82279 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRB1P82279 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CRB1P82279 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRB1P82279 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRB1P82279 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRB1P82279 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRB1P82279 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRB1P82279 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRB1P82279 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CRB1P82279 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CRB1P82279 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CRB1P82279 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CRB1P82279 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CRB1P82279 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CRB1P82279 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CRB1P82279 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CRB1P82279 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CRB1P82279 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CRB1P82279 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CRB1P82279 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CRB1P82279 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CRB1P82279 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CRB1P82279 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CRB1P82279 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CRB1P82279 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CRB1P82279 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CRB1P82279 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CRB1P82279 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CRB1P82279 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CRB1P82279 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CRB1P82279 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CRB1P82279 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CRB1P82279 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CRB1P82279 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CRB1P82279 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CRB1P82279 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CRB1P82279 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CRB1P82279 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CRB1P82279 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CRB1P82279 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CRB1P82279 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CRB1P82279 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CRB1P82279 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms