Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIM1P81133 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIM1P81133 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIM1P81133 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIM1P81133 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIM1P81133 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SIM1P81133 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIM1P81133 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIM1P81133 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIM1P81133 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIM1P81133 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SIM1P81133 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SIM1P81133 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIM1P81133 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIM1P81133 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SIM1P81133 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIM1P81133 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIM1P81133 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIM1P81133 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIM1P81133 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIM1P81133 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIM1P81133 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIM1P81133 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIM1P81133 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIM1P81133 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIM1P81133 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIM1P81133 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIM1P81133 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIM1P81133 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIM1P81133 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIM1P81133 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIM1P81133 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SIM1P81133 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIM1P81133 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIM1P81133 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIM1P81133 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIM1P81133 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SIM1P81133 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIM1P81133 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIM1P81133 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIM1P81133 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIM1P81133 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIM1P81133 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIM1P81133 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIM1P81133 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIM1P81133 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIM1P81133 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIM1P81133 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIM1P81133 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SIM1P81133 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIM1P81133 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIM1P81133 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIM1P81133 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIM1P81133 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIM1P81133 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIM1P81133 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIM1P81133 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIM1P81133 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIM1P81133 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SIM1P81133 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIM1P81133 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIM1P81133 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIM1P81133 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIM1P81133 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIM1P81133 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIM1P81133 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIM1P81133 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIM1P81133 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIM1P81133 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIM1P81133 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIM1P81133 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIM1P81133 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SIM1P81133 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIM1P81133 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SIM1P81133 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIM1P81133 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SIM1P81133 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIM1P81133 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIM1P81133 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIM1P81133 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIM1P81133 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIM1P81133 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIM1P81133 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIM1P81133 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIM1P81133 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIM1P81133 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIM1P81133 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIM1P81133 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIM1P81133 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIM1P81133 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SIM1P81133 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIM1P81133 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIM1P81133 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIM1P81133 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIM1P81133 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIM1P81133 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIM1P81133 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SIM1P81133 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIM1P81133 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIM1P81133 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms