Protein–RNA interactions for Protein: P68104

EEF1A1, Elongation factor 1-alpha 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1A1P68104 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms