Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms