Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms