Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GJA9P57773 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GJA9P57773 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GJA9P57773 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GJA9P57773 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GJA9P57773 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GJA9P57773 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GJA9P57773 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GJA9P57773 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GJA9P57773 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GJA9P57773 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GJA9P57773 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GJA9P57773 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GJA9P57773 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GJA9P57773 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GJA9P57773 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GJA9P57773 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GJA9P57773 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GJA9P57773 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GJA9P57773 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GJA9P57773 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GJA9P57773 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GJA9P57773 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GJA9P57773 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GJA9P57773 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GJA9P57773 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GJA9P57773 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GJA9P57773 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GJA9P57773 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GJA9P57773 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GJA9P57773 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GJA9P57773 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GJA9P57773 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GJA9P57773 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GJA9P57773 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GJA9P57773 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GJA9P57773 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GJA9P57773 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GJA9P57773 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GJA9P57773 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJA9P57773 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJA9P57773 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJA9P57773 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJA9P57773 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJA9P57773 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJA9P57773 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJA9P57773 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJA9P57773 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJA9P57773 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJA9P57773 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJA9P57773 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJA9P57773 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJA9P57773 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJA9P57773 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJA9P57773 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJA9P57773 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJA9P57773 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJA9P57773 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJA9P57773 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJA9P57773 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJA9P57773 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJA9P57773 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJA9P57773 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJA9P57773 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJA9P57773 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJA9P57773 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJA9P57773 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJA9P57773 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJA9P57773 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJA9P57773 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GJA9P57773 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJA9P57773 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJA9P57773 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJA9P57773 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJA9P57773 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJA9P57773 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJA9P57773 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJA9P57773 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJA9P57773 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJA9P57773 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJA9P57773 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJA9P57773 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJA9P57773 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
GJA9P57773 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
GJA9P57773 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
GJA9P57773 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GJA9P57773 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GJA9P57773 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GJA9P57773 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GJA9P57773 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GJA9P57773 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GJA9P57773 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GJA9P57773 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GJA9P57773 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GJA9P57773 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GJA9P57773 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GJA9P57773 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GJA9P57773 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GJA9P57773 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GJA9P57773 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms