Protein–RNA interactions for Protein: P57739

CLDN2, Claudin-2, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN2P57739 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms