Protein–RNA interactions for Protein: P54852

EMP3, Epithelial membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP3P54852 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EMP3P54852 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EMP3P54852 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EMP3P54852 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EMP3P54852 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EMP3P54852 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EMP3P54852 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EMP3P54852 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EMP3P54852 AC087273.1-201ENST00000519368 529 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EMP3P54852 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EMP3P54852 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EMP3P54852 AC009652.1-201ENST00000528326 648 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EMP3P54852 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EMP3P54852 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EMP3P54852 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EMP3P54852 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EMP3P54852 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EMP3P54852 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EMP3P54852 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EMP3P54852 AP000280.1-201ENST00000624800 832 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EMP3P54852 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EMP3P54852 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EMP3P54852 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EMP3P54852 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EMP3P54852 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EMP3P54852 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EMP3P54852 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EMP3P54852 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EMP3P54852 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EMP3P54852 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EMP3P54852 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
EMP3P54852 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
EMP3P54852 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
EMP3P54852 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
EMP3P54852 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
EMP3P54852 AL117378.2-201ENST00000622916 1337 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
EMP3P54852 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EMP3P54852 MTCO1P15-201ENST00000529569 1526 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
EMP3P54852 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EMP3P54852 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EMP3P54852 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EMP3P54852 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
EMP3P54852 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EMP3P54852 TIMM10-201ENST00000257245 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EMP3P54852 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EMP3P54852 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EMP3P54852 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
EMP3P54852 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EMP3P54852 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EMP3P54852 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EMP3P54852 AC083923.2-202ENST00000517773 498 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EMP3P54852 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EMP3P54852 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EMP3P54852 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EMP3P54852 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EMP3P54852 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
EMP3P54852 C1orf132-204ENST00000637970 1170 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EMP3P54852 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EMP3P54852 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
EMP3P54852 PDHB-210ENST00000485460 1397 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EMP3P54852 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EMP3P54852 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EMP3P54852 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EMP3P54852 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EMP3P54852 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EMP3P54852 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EMP3P54852 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EMP3P54852 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EMP3P54852 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EMP3P54852 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EMP3P54852 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EMP3P54852 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EMP3P54852 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EMP3P54852 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EMP3P54852 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EMP3P54852 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EMP3P54852 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EMP3P54852 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EMP3P54852 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EMP3P54852 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EMP3P54852 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EMP3P54852 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EMP3P54852 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EMP3P54852 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EMP3P54852 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EMP3P54852 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EMP3P54852 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EMP3P54852 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EMP3P54852 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EMP3P54852 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EMP3P54852 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EMP3P54852 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EMP3P54852 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EMP3P54852 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EMP3P54852 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EMP3P54852 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EMP3P54852 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EMP3P54852 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EMP3P54852 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EMP3P54852 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms