Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPAP53621 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPAP53621 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPAP53621 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPAP53621 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPAP53621 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPAP53621 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPAP53621 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPAP53621 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPAP53621 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPAP53621 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPAP53621 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPAP53621 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
COPAP53621 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPAP53621 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPAP53621 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPAP53621 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPAP53621 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPAP53621 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPAP53621 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPAP53621 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPAP53621 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPAP53621 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPAP53621 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPAP53621 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPAP53621 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPAP53621 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
COPAP53621 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPAP53621 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPAP53621 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPAP53621 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPAP53621 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
COPAP53621 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPAP53621 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPAP53621 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPAP53621 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
COPAP53621 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPAP53621 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPAP53621 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
COPAP53621 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPAP53621 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPAP53621 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPAP53621 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPAP53621 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPAP53621 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPAP53621 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPAP53621 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPAP53621 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPAP53621 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPAP53621 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPAP53621 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPAP53621 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPAP53621 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
COPAP53621 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPAP53621 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
COPAP53621 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
COPAP53621 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
COPAP53621 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
COPAP53621 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
COPAP53621 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
COPAP53621 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
COPAP53621 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
COPAP53621 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
COPAP53621 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
COPAP53621 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
COPAP53621 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
COPAP53621 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
COPAP53621 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
COPAP53621 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
COPAP53621 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
COPAP53621 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
COPAP53621 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
COPAP53621 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
COPAP53621 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
COPAP53621 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
COPAP53621 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
COPAP53621 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
COPAP53621 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
COPAP53621 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
COPAP53621 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
COPAP53621 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
COPAP53621 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
COPAP53621 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
COPAP53621 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
COPAP53621 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
COPAP53621 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
COPAP53621 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
COPAP53621 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
COPAP53621 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
COPAP53621 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
COPAP53621 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
COPAP53621 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
COPAP53621 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
COPAP53621 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
COPAP53621 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
COPAP53621 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
COPAP53621 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
COPAP53621 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
COPAP53621 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
COPAP53621 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms