Protein–RNA interactions for Protein: P53602

MVD, Diphosphomevalonate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVDP53602 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MVDP53602 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MVDP53602 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MVDP53602 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MVDP53602 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MVDP53602 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MVDP53602 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MVDP53602 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MVDP53602 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MVDP53602 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MVDP53602 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MVDP53602 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MVDP53602 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MVDP53602 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MVDP53602 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MVDP53602 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MVDP53602 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MVDP53602 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MVDP53602 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MVDP53602 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MVDP53602 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MVDP53602 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MVDP53602 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MVDP53602 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MVDP53602 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MVDP53602 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MVDP53602 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MVDP53602 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MVDP53602 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MVDP53602 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MVDP53602 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MVDP53602 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MVDP53602 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MVDP53602 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MVDP53602 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MVDP53602 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MVDP53602 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MVDP53602 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MVDP53602 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MVDP53602 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MVDP53602 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MVDP53602 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MVDP53602 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MVDP53602 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MVDP53602 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MVDP53602 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MVDP53602 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MVDP53602 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MVDP53602 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MVDP53602 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MVDP53602 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MVDP53602 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MVDP53602 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MVDP53602 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MVDP53602 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MVDP53602 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MVDP53602 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MVDP53602 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MVDP53602 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MVDP53602 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MVDP53602 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MVDP53602 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MVDP53602 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MVDP53602 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MVDP53602 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MVDP53602 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MVDP53602 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MVDP53602 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MVDP53602 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MVDP53602 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MVDP53602 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MVDP53602 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MVDP53602 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MVDP53602 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MVDP53602 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MVDP53602 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MVDP53602 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MVDP53602 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MVDP53602 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MVDP53602 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MVDP53602 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MVDP53602 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MVDP53602 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MVDP53602 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MVDP53602 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MVDP53602 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MVDP53602 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MVDP53602 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MVDP53602 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MVDP53602 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MVDP53602 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MVDP53602 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MVDP53602 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MVDP53602 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MVDP53602 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MVDP53602 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MVDP53602 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MVDP53602 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MVDP53602 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MVDP53602 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms