Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCR4P51679 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCR4P51679 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCR4P51679 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCR4P51679 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCR4P51679 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCR4P51679 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCR4P51679 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCR4P51679 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCR4P51679 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCR4P51679 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCR4P51679 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCR4P51679 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCR4P51679 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCR4P51679 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCR4P51679 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCR4P51679 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCR4P51679 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCR4P51679 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCR4P51679 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCR4P51679 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCR4P51679 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCR4P51679 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCR4P51679 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCR4P51679 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCR4P51679 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCR4P51679 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCR4P51679 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCR4P51679 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCR4P51679 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCR4P51679 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCR4P51679 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCR4P51679 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCR4P51679 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCR4P51679 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCR4P51679 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCR4P51679 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCR4P51679 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCR4P51679 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCR4P51679 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCR4P51679 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCR4P51679 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCR4P51679 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCR4P51679 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCR4P51679 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCR4P51679 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCR4P51679 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCR4P51679 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCR4P51679 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCR4P51679 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCR4P51679 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCR4P51679 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCR4P51679 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCR4P51679 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCR4P51679 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCR4P51679 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCR4P51679 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCR4P51679 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCR4P51679 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCR4P51679 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CCR4P51679 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCR4P51679 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCR4P51679 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCR4P51679 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCR4P51679 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCR4P51679 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCR4P51679 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCR4P51679 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCR4P51679 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCR4P51679 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCR4P51679 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCR4P51679 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCR4P51679 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCR4P51679 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCR4P51679 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCR4P51679 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCR4P51679 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCR4P51679 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCR4P51679 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCR4P51679 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCR4P51679 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCR4P51679 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCR4P51679 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCR4P51679 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCR4P51679 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCR4P51679 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCR4P51679 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCR4P51679 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCR4P51679 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCR4P51679 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CCR4P51679 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCR4P51679 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCR4P51679 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCR4P51679 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCR4P51679 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCR4P51679 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCR4P51679 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCR4P51679 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCR4P51679 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCR4P51679 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms