Protein–RNA interactions for Protein: P50747

HLCS, Biotin--protein ligase, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLCSP50747 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLCSP50747 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLCSP50747 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLCSP50747 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLCSP50747 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLCSP50747 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLCSP50747 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLCSP50747 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLCSP50747 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLCSP50747 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLCSP50747 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLCSP50747 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLCSP50747 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLCSP50747 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLCSP50747 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLCSP50747 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLCSP50747 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLCSP50747 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLCSP50747 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLCSP50747 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLCSP50747 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLCSP50747 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLCSP50747 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLCSP50747 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLCSP50747 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLCSP50747 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLCSP50747 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLCSP50747 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLCSP50747 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HLCSP50747 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLCSP50747 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLCSP50747 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HLCSP50747 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLCSP50747 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLCSP50747 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLCSP50747 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HLCSP50747 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLCSP50747 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLCSP50747 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HLCSP50747 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLCSP50747 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HLCSP50747 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLCSP50747 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLCSP50747 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLCSP50747 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLCSP50747 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLCSP50747 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLCSP50747 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLCSP50747 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLCSP50747 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLCSP50747 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLCSP50747 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLCSP50747 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLCSP50747 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLCSP50747 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLCSP50747 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLCSP50747 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLCSP50747 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HLCSP50747 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLCSP50747 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLCSP50747 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLCSP50747 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLCSP50747 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLCSP50747 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLCSP50747 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLCSP50747 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLCSP50747 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLCSP50747 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HLCSP50747 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLCSP50747 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLCSP50747 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HLCSP50747 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLCSP50747 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLCSP50747 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLCSP50747 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLCSP50747 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLCSP50747 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLCSP50747 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLCSP50747 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLCSP50747 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLCSP50747 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HLCSP50747 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLCSP50747 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLCSP50747 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLCSP50747 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLCSP50747 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLCSP50747 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLCSP50747 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLCSP50747 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLCSP50747 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLCSP50747 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLCSP50747 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLCSP50747 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLCSP50747 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLCSP50747 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLCSP50747 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLCSP50747 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HLCSP50747 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLCSP50747 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLCSP50747 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms