Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms