Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLK1P49759 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLK1P49759 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLK1P49759 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLK1P49759 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLK1P49759 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLK1P49759 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLK1P49759 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLK1P49759 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLK1P49759 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLK1P49759 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLK1P49759 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLK1P49759 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLK1P49759 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CLK1P49759 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CLK1P49759 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CLK1P49759 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLK1P49759 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLK1P49759 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLK1P49759 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLK1P49759 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLK1P49759 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLK1P49759 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLK1P49759 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLK1P49759 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLK1P49759 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLK1P49759 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLK1P49759 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLK1P49759 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLK1P49759 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLK1P49759 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLK1P49759 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLK1P49759 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CLK1P49759 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLK1P49759 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLK1P49759 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLK1P49759 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLK1P49759 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLK1P49759 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLK1P49759 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLK1P49759 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CLK1P49759 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CLK1P49759 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CLK1P49759 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CLK1P49759 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLK1P49759 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLK1P49759 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLK1P49759 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLK1P49759 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLK1P49759 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLK1P49759 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLK1P49759 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLK1P49759 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CLK1P49759 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLK1P49759 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLK1P49759 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLK1P49759 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLK1P49759 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CLK1P49759 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLK1P49759 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLK1P49759 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLK1P49759 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLK1P49759 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLK1P49759 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLK1P49759 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
CLK1P49759 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLK1P49759 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLK1P49759 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLK1P49759 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLK1P49759 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CLK1P49759 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLK1P49759 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CLK1P49759 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLK1P49759 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLK1P49759 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLK1P49759 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLK1P49759 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLK1P49759 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CLK1P49759 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLK1P49759 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLK1P49759 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLK1P49759 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLK1P49759 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLK1P49759 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLK1P49759 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLK1P49759 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLK1P49759 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLK1P49759 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLK1P49759 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLK1P49759 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CLK1P49759 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLK1P49759 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLK1P49759 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLK1P49759 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CLK1P49759 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLK1P49759 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CLK1P49759 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLK1P49759 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLK1P49759 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLK1P49759 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms