Protein–RNA interactions for Protein: P43897

TSFM, Elongation factor Ts, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSFMP43897 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSFMP43897 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSFMP43897 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSFMP43897 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSFMP43897 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSFMP43897 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSFMP43897 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSFMP43897 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSFMP43897 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSFMP43897 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSFMP43897 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSFMP43897 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSFMP43897 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSFMP43897 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSFMP43897 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSFMP43897 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSFMP43897 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSFMP43897 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TSFMP43897 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSFMP43897 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSFMP43897 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSFMP43897 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSFMP43897 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSFMP43897 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSFMP43897 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSFMP43897 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSFMP43897 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TSFMP43897 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSFMP43897 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSFMP43897 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSFMP43897 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSFMP43897 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSFMP43897 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSFMP43897 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSFMP43897 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSFMP43897 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSFMP43897 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TSFMP43897 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TSFMP43897 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TSFMP43897 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TSFMP43897 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TSFMP43897 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TSFMP43897 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TSFMP43897 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSFMP43897 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TSFMP43897 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSFMP43897 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSFMP43897 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSFMP43897 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSFMP43897 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSFMP43897 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSFMP43897 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSFMP43897 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSFMP43897 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSFMP43897 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSFMP43897 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSFMP43897 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSFMP43897 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSFMP43897 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TSFMP43897 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSFMP43897 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSFMP43897 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TSFMP43897 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSFMP43897 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSFMP43897 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSFMP43897 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSFMP43897 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSFMP43897 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSFMP43897 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSFMP43897 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSFMP43897 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSFMP43897 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TSFMP43897 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSFMP43897 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSFMP43897 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSFMP43897 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSFMP43897 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSFMP43897 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSFMP43897 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSFMP43897 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSFMP43897 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSFMP43897 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSFMP43897 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSFMP43897 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSFMP43897 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSFMP43897 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSFMP43897 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSFMP43897 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSFMP43897 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSFMP43897 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSFMP43897 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSFMP43897 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSFMP43897 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSFMP43897 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSFMP43897 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSFMP43897 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSFMP43897 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSFMP43897 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSFMP43897 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSFMP43897 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms