Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GDF5P43026 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GDF5P43026 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GDF5P43026 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GDF5P43026 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GDF5P43026 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GDF5P43026 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GDF5P43026 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GDF5P43026 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GDF5P43026 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GDF5P43026 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GDF5P43026 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GDF5P43026 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GDF5P43026 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GDF5P43026 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GDF5P43026 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GDF5P43026 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GDF5P43026 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GDF5P43026 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GDF5P43026 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GDF5P43026 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GDF5P43026 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GDF5P43026 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GDF5P43026 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GDF5P43026 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GDF5P43026 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GDF5P43026 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDF5P43026 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDF5P43026 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDF5P43026 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDF5P43026 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDF5P43026 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDF5P43026 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDF5P43026 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDF5P43026 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDF5P43026 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDF5P43026 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDF5P43026 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDF5P43026 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDF5P43026 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDF5P43026 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDF5P43026 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDF5P43026 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDF5P43026 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GDF5P43026 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDF5P43026 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDF5P43026 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDF5P43026 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GDF5P43026 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDF5P43026 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDF5P43026 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDF5P43026 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDF5P43026 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDF5P43026 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDF5P43026 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDF5P43026 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDF5P43026 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDF5P43026 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDF5P43026 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDF5P43026 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDF5P43026 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDF5P43026 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDF5P43026 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDF5P43026 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDF5P43026 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDF5P43026 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDF5P43026 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDF5P43026 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDF5P43026 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDF5P43026 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDF5P43026 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDF5P43026 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDF5P43026 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDF5P43026 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDF5P43026 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDF5P43026 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDF5P43026 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDF5P43026 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDF5P43026 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDF5P43026 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GDF5P43026 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDF5P43026 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDF5P43026 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GDF5P43026 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GDF5P43026 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDF5P43026 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDF5P43026 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDF5P43026 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDF5P43026 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDF5P43026 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDF5P43026 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDF5P43026 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDF5P43026 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDF5P43026 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDF5P43026 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDF5P43026 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDF5P43026 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDF5P43026 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDF5P43026 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDF5P43026 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms