Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms