Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms