Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPC1P35052 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPC1P35052 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPC1P35052 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPC1P35052 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPC1P35052 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPC1P35052 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC1P35052 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC1P35052 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC1P35052 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC1P35052 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC1P35052 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC1P35052 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC1P35052 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC1P35052 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC1P35052 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC1P35052 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC1P35052 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC1P35052 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC1P35052 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC1P35052 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC1P35052 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC1P35052 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC1P35052 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC1P35052 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC1P35052 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC1P35052 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC1P35052 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC1P35052 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC1P35052 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC1P35052 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC1P35052 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC1P35052 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC1P35052 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC1P35052 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC1P35052 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC1P35052 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC1P35052 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC1P35052 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC1P35052 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC1P35052 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC1P35052 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC1P35052 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC1P35052 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC1P35052 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC1P35052 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC1P35052 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC1P35052 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC1P35052 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC1P35052 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC1P35052 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC1P35052 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC1P35052 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC1P35052 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC1P35052 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC1P35052 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC1P35052 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC1P35052 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC1P35052 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC1P35052 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC1P35052 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC1P35052 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC1P35052 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC1P35052 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC1P35052 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC1P35052 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC1P35052 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC1P35052 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC1P35052 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC1P35052 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPC1P35052 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPC1P35052 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPC1P35052 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPC1P35052 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPC1P35052 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPC1P35052 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPC1P35052 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPC1P35052 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPC1P35052 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GPC1P35052 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPC1P35052 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPC1P35052 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPC1P35052 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPC1P35052 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPC1P35052 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GPC1P35052 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPC1P35052 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPC1P35052 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPC1P35052 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPC1P35052 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPC1P35052 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPC1P35052 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPC1P35052 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPC1P35052 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPC1P35052 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPC1P35052 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPC1P35052 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPC1P35052 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPC1P35052 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC1P35052 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms