Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
APCP25054 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
APCP25054 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
APCP25054 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
APCP25054 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
APCP25054 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
APCP25054 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
APCP25054 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
APCP25054 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
APCP25054 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
APCP25054 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
APCP25054 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
APCP25054 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
APCP25054 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
APCP25054 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
APCP25054 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
APCP25054 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
APCP25054 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
APCP25054 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
APCP25054 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
APCP25054 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
APCP25054 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
APCP25054 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
APCP25054 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
APCP25054 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
APCP25054 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
APCP25054 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
APCP25054 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
APCP25054 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.27
APCP25054 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
APCP25054 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.27
APCP25054 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
APCP25054 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
APCP25054 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
APCP25054 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
APCP25054 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
APCP25054 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
APCP25054 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
APCP25054 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
APCP25054 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
APCP25054 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
APCP25054 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
APCP25054 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
APCP25054 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
APCP25054 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
APCP25054 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
APCP25054 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
APCP25054 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
APCP25054 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
APCP25054 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
APCP25054 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
APCP25054 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
APCP25054 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
APCP25054 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
APCP25054 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
APCP25054 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
APCP25054 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
APCP25054 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
APCP25054 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
APCP25054 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
APCP25054 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
APCP25054 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
APCP25054 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
APCP25054 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
APCP25054 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
APCP25054 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
APCP25054 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
APCP25054 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
APCP25054 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
APCP25054 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
APCP25054 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
APCP25054 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
APCP25054 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
APCP25054 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
APCP25054 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
APCP25054 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
APCP25054 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
APCP25054 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
APCP25054 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
APCP25054 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
APCP25054 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
APCP25054 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
APCP25054 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
APCP25054 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
APCP25054 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
APCP25054 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
APCP25054 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
APCP25054 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
APCP25054 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
APCP25054 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
APCP25054 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
APCP25054 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
APCP25054 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
APCP25054 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
APCP25054 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
APCP25054 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
APCP25054 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
APCP25054 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
APCP25054 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
APCP25054 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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