Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms