Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms