Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SDSP20132 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SDSP20132 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SDSP20132 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SDSP20132 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SDSP20132 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SDSP20132 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SDSP20132 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SDSP20132 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SDSP20132 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SDSP20132 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SDSP20132 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SDSP20132 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SDSP20132 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SDSP20132 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SDSP20132 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SDSP20132 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SDSP20132 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SDSP20132 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SDSP20132 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SDSP20132 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SDSP20132 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SDSP20132 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SDSP20132 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SDSP20132 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SDSP20132 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SDSP20132 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SDSP20132 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SDSP20132 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SDSP20132 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SDSP20132 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SDSP20132 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SDSP20132 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SDSP20132 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SDSP20132 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SDSP20132 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SDSP20132 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SDSP20132 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SDSP20132 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SDSP20132 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SDSP20132 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SDSP20132 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SDSP20132 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SDSP20132 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SDSP20132 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SDSP20132 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SDSP20132 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SDSP20132 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SDSP20132 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SDSP20132 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SDSP20132 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SDSP20132 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SDSP20132 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SDSP20132 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SDSP20132 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SDSP20132 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SDSP20132 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SDSP20132 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SDSP20132 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SDSP20132 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SDSP20132 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SDSP20132 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SDSP20132 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SDSP20132 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SDSP20132 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SDSP20132 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SDSP20132 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SDSP20132 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SDSP20132 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SDSP20132 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SDSP20132 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SDSP20132 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SDSP20132 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SDSP20132 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SDSP20132 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SDSP20132 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SDSP20132 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SDSP20132 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SDSP20132 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SDSP20132 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SDSP20132 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SDSP20132 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SDSP20132 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SDSP20132 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SDSP20132 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SDSP20132 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SDSP20132 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SDSP20132 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SDSP20132 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SDSP20132 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SDSP20132 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SDSP20132 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SDSP20132 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SDSP20132 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SDSP20132 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SDSP20132 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SDSP20132 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SDSP20132 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SDSP20132 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SDSP20132 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms