Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms