Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms