Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GLI3P10071 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GLI3P10071 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GLI3P10071 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GLI3P10071 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GLI3P10071 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GLI3P10071 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GLI3P10071 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GLI3P10071 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GLI3P10071 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GLI3P10071 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GLI3P10071 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GLI3P10071 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GLI3P10071 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GLI3P10071 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GLI3P10071 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GLI3P10071 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GLI3P10071 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GLI3P10071 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GLI3P10071 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GLI3P10071 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GLI3P10071 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GLI3P10071 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GLI3P10071 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GLI3P10071 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GLI3P10071 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GLI3P10071 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GLI3P10071 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GLI3P10071 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GLI3P10071 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GLI3P10071 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GLI3P10071 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GLI3P10071 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GLI3P10071 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GLI3P10071 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GLI3P10071 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GLI3P10071 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GLI3P10071 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GLI3P10071 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GLI3P10071 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GLI3P10071 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GLI3P10071 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GLI3P10071 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GLI3P10071 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GLI3P10071 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GLI3P10071 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GLI3P10071 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GLI3P10071 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GLI3P10071 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GLI3P10071 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GLI3P10071 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GLI3P10071 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GLI3P10071 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GLI3P10071 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GLI3P10071 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GLI3P10071 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GLI3P10071 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GLI3P10071 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GLI3P10071 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GLI3P10071 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GLI3P10071 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GLI3P10071 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GLI3P10071 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GLI3P10071 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GLI3P10071 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GLI3P10071 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GLI3P10071 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GLI3P10071 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GLI3P10071 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GLI3P10071 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GLI3P10071 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GLI3P10071 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GLI3P10071 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GLI3P10071 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GLI3P10071 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GLI3P10071 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GLI3P10071 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GLI3P10071 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GLI3P10071 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GLI3P10071 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GLI3P10071 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GLI3P10071 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GLI3P10071 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GLI3P10071 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GLI3P10071 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GLI3P10071 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GLI3P10071 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GLI3P10071 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GLI3P10071 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GLI3P10071 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GLI3P10071 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GLI3P10071 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GLI3P10071 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GLI3P10071 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GLI3P10071 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GLI3P10071 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GLI3P10071 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GLI3P10071 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GLI3P10071 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
GLI3P10071 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms