Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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