Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APODP05090 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APODP05090 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APODP05090 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APODP05090 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APODP05090 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APODP05090 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APODP05090 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
APODP05090 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APODP05090 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APODP05090 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APODP05090 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APODP05090 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APODP05090 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APODP05090 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APODP05090 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
APODP05090 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APODP05090 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APODP05090 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
APODP05090 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APODP05090 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APODP05090 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
APODP05090 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
APODP05090 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
APODP05090 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
APODP05090 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
APODP05090 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
APODP05090 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
APODP05090 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APODP05090 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APODP05090 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APODP05090 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APODP05090 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APODP05090 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APODP05090 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APODP05090 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APODP05090 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
APODP05090 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APODP05090 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APODP05090 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APODP05090 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APODP05090 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APODP05090 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APODP05090 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APODP05090 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APODP05090 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APODP05090 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APODP05090 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APODP05090 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APODP05090 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APODP05090 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APODP05090 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APODP05090 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APODP05090 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APODP05090 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APODP05090 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APODP05090 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APODP05090 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APODP05090 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APODP05090 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APODP05090 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APODP05090 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APODP05090 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APODP05090 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APODP05090 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APODP05090 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APODP05090 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APODP05090 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APODP05090 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APODP05090 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APODP05090 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APODP05090 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APODP05090 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APODP05090 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APODP05090 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APODP05090 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APODP05090 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APODP05090 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
APODP05090 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
APODP05090 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APODP05090 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APODP05090 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APODP05090 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APODP05090 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APODP05090 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APODP05090 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APODP05090 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APODP05090 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APODP05090 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APODP05090 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APODP05090 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APODP05090 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APODP05090 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
APODP05090 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APODP05090 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APODP05090 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APODP05090 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APODP05090 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APODP05090 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
APODP05090 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.5 ms