Protein–RNA interactions for Protein: O60235

TMPRSS11D, Transmembrane protease serine 11D, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS11DO60235 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMPRSS11DO60235 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMPRSS11DO60235 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMPRSS11DO60235 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMPRSS11DO60235 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMPRSS11DO60235 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMPRSS11DO60235 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMPRSS11DO60235 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMPRSS11DO60235 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMPRSS11DO60235 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMPRSS11DO60235 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMPRSS11DO60235 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMPRSS11DO60235 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMPRSS11DO60235 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMPRSS11DO60235 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMPRSS11DO60235 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMPRSS11DO60235 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMPRSS11DO60235 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMPRSS11DO60235 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMPRSS11DO60235 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms