Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

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Length 550 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COCHO43405 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COCHO43405 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COCHO43405 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
COCHO43405 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COCHO43405 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COCHO43405 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COCHO43405 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COCHO43405 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COCHO43405 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COCHO43405 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COCHO43405 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COCHO43405 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COCHO43405 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COCHO43405 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COCHO43405 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
COCHO43405 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COCHO43405 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COCHO43405 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COCHO43405 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COCHO43405 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COCHO43405 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COCHO43405 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
COCHO43405 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COCHO43405 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COCHO43405 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COCHO43405 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COCHO43405 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COCHO43405 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COCHO43405 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COCHO43405 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COCHO43405 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COCHO43405 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COCHO43405 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COCHO43405 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COCHO43405 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COCHO43405 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COCHO43405 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COCHO43405 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COCHO43405 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COCHO43405 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COCHO43405 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COCHO43405 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COCHO43405 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COCHO43405 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
COCHO43405 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COCHO43405 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COCHO43405 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COCHO43405 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COCHO43405 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COCHO43405 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COCHO43405 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COCHO43405 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COCHO43405 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COCHO43405 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
COCHO43405 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COCHO43405 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COCHO43405 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
COCHO43405 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
COCHO43405 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COCHO43405 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COCHO43405 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COCHO43405 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
COCHO43405 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COCHO43405 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COCHO43405 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COCHO43405 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COCHO43405 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COCHO43405 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COCHO43405 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COCHO43405 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
COCHO43405 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COCHO43405 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COCHO43405 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
COCHO43405 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COCHO43405 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COCHO43405 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COCHO43405 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COCHO43405 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COCHO43405 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COCHO43405 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COCHO43405 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COCHO43405 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COCHO43405 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COCHO43405 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COCHO43405 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COCHO43405 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COCHO43405 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COCHO43405 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COCHO43405 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COCHO43405 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COCHO43405 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COCHO43405 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COCHO43405 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COCHO43405 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COCHO43405 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COCHO43405 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COCHO43405 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COCHO43405 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COCHO43405 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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