Protein–RNA interactions for Protein: O43248

HOXC11, Homeobox protein Hox-C11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11O43248 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms