Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLGNO14967 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CLGNO14967 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CLGNO14967 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CLGNO14967 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CLGNO14967 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLGNO14967 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLGNO14967 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLGNO14967 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLGNO14967 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLGNO14967 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLGNO14967 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLGNO14967 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLGNO14967 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLGNO14967 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLGNO14967 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLGNO14967 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLGNO14967 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLGNO14967 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLGNO14967 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLGNO14967 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLGNO14967 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLGNO14967 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLGNO14967 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLGNO14967 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLGNO14967 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLGNO14967 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLGNO14967 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLGNO14967 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLGNO14967 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLGNO14967 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLGNO14967 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLGNO14967 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLGNO14967 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLGNO14967 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLGNO14967 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLGNO14967 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLGNO14967 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLGNO14967 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLGNO14967 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLGNO14967 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLGNO14967 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLGNO14967 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLGNO14967 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLGNO14967 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLGNO14967 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLGNO14967 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLGNO14967 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLGNO14967 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLGNO14967 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLGNO14967 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLGNO14967 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLGNO14967 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLGNO14967 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLGNO14967 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLGNO14967 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLGNO14967 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CLGNO14967 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLGNO14967 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLGNO14967 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLGNO14967 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLGNO14967 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLGNO14967 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CLGNO14967 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLGNO14967 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLGNO14967 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLGNO14967 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLGNO14967 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLGNO14967 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLGNO14967 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLGNO14967 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CLGNO14967 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLGNO14967 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLGNO14967 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLGNO14967 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLGNO14967 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLGNO14967 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLGNO14967 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLGNO14967 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLGNO14967 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLGNO14967 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLGNO14967 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLGNO14967 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLGNO14967 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLGNO14967 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLGNO14967 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLGNO14967 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLGNO14967 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLGNO14967 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLGNO14967 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLGNO14967 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLGNO14967 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLGNO14967 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLGNO14967 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLGNO14967 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLGNO14967 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLGNO14967 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLGNO14967 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLGNO14967 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLGNO14967 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms