Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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