Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 AL157938.2-207ENST00000415391 884 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 AC073115.1-201ENST00000436056 532 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 LRRIQ3-203ENST00000370911 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 AC025524.2-206ENST00000517953 439 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms