Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms