Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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ARL2-SNX15V9GYD0 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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