Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms