Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms