Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y448

KNSTRN, Small kinetochore-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRNQ9Y448 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms