Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW6

SATB2, DNA-binding protein SATB2, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB2Q9UPW6 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms