Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms