Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ9

TNRC6B, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6BQ9UPQ9 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms