Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNF0

PACSIN2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN2Q9UNF0 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PACSIN2Q9UNF0 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms