Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN37

VPS4A, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS4AQ9UN37 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms