Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J9

PDP2, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP2Q9P2J9 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDP2Q9P2J9 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms